Polizeiruf 110

Staffel zehn setzt am Ende der vorherigen Staffel an. Dr. Mallard überlebt seinen Herzinfarkt und liegt nun im Krankenhaus. Durch die Explosion vor dem NCIS-Hauptquartier wurden viele Agenten verletzt oder getötet. Es kommen jedoch keine für die Handlung bedeutenden Personen ums Leben. Ziva und Tony überleben, da sie im Fahrstuhl stecken geblieben sind, als die Bombe hochging. Sie hatten eine lange Zeit zu überbrücken, von der man jedoch nicht alles erfährt. Die Jagd nach dem Terroristen Harper Dearing geht weiter. Nachdem schließlich eine FBI-Aktion, Dearing zu töten, scheitert, begibt sich Gibbs allein auf die Suche nach Dearing und findet ihn in dem Haus, in dem Evan geboren wurde. Nachdem Dearing Gibbs seine Gründe erläutert und erklärt hat, dass er ihn erwartete, greift er nach einer Waffe und wird von Gibbs erstochen. In der Doppelfolge Shabbat Shalom und Shiva kommt Eli David unter dem Vorwand, seine Tochter Ziva besuchen zu wollen, nach Washington D.C. In Wahrheit hat er jedoch ein geheimes Treffen mit dem Chef des iranischen Geheimdienstes Arash Kazmi, einem Freund aus seiner Jugend, arrangiert, um Frieden zwischen Palästina/Iran und Irak zu wahren. Eli David stirbt zusammen mit Director Vances Frau Jackie bei einem Anschlag auf Vances Haus. Verantwortlich dafür ist Ilan Bodnar, Davids Stellvertreter und potentieller Nachfolger beim Mossad, der versucht den Frieden zu verhindern. Bodnar, der ebenfalls in Washington ist, gelingt die Flucht. In der letzten Szene der zweiten Folge wird Kazmi durch eine Autobombe getötet. Später tötet Ziva Ilan Bodnar, was zu Ermittlungen durch das DoD führt. Dadurch wird Gibbs’ Vergangenheit erneut angesprochen, was zur Folge hat, dass Ermittlungen gegen ihn eingeleitet werden. Der frühere Judge Advocate General A. J. Chegwidden übernimmt seine Verteidigung. Letztlich kommt es dazu, dass Tony, Tim und Ziva ihre Dienstmarken abgeben und den Dienst beim NCIS quittieren. Gibbs befindet sich vier Monate später an einem Gewehr und zielt damit auf T. C. Fornell, seinen besten Freund vom FBI.

Die erste Folge der dritten Staffel beginnt mit der Rückblende des Todes von Agent Kate Todd. Die Jagd auf Ari Haswari beginnt und das Team kommt dabei dem Terroristen gefährlich nah. Todd taucht in Erscheinungen der NCIS-Mitglieder auf und macht ihnen klar, dass sie sich keine Vorwürfe machen sollen. Als Haswari im Keller von Gibbs’ Haus droht, diesen zu töten, wird er von seiner Halbschwester Ziva David erschossen. Ziva David ist eine Mossad-Agentin, die zur Unterstützung nach Washington gekommen ist. Anschließend wird sie zur Verbindungsoffizierin für den NCIS. Der Direktor des NCIS, Thomas Morrow, wechselt als stellv. Direktor zur Homeland Security. Seine Nachfolgerin wird Jenny Shepard, Gibbs’ frühere Partnerin und Romanze. Aufgrund dieser Vergangenheit fällt es ihr oft schwer, Gibbs Befehle zu geben. Dennoch führen sie eine distanzierte Beziehung und verstehen sich gut. Im Staffelfinale wird Gibbs von einer Explosion schwer verletzt und fällt ins Koma. Nachdem er erwacht, kann er sich an nichts mehr erinnern, was in den letzten 15 Jahren passiert ist. Nur sein Mentor und alter Freund Mike Franks kann ihm helfen, sich wieder zu erinnern. Nachdem Gibbs sein Gedächtnis vollständig zurückbekommen hat, quittiert er den Dienst, geht in Frühpension und geht mit Franks nach Mexiko.

In der ersten Folge und über mehrere Folgen der Staffel hinweg versuchen Gibbs und Fornell den Verantwortlichen zu finden, der Fornells Tochter Drogen verabreicht hat; jene verstirbt im Laufe der Staffel. Zwischenzeitlich wird bekannt, wie sich Gibbs und Ducky kennenlernten, als eine Leiche im Keller des Navyyards auftaucht. Der Verantwortliche kann gefunden werden. In der achten Folge führt ein Fall das Team nach Afghanistan, als Sloane von der Vergangenheit eingeholt wird. Am Ende der Folge verabschiedet sie sich vom Team, um die Möglichkeiten für Bildung von Frauen zu verbessern. Später wird Gibbs von Vance suspendiert, als ersterer einem Täter gegenüber ziemlich handgreiflich wird und diesen fast krankenhausreif prügelt. Daraufhin übernimmt McGee die Leitung. Gibbs wiederum wird in einem Diner von der Investigativjournalistin Marcie Warren angesprochen und untersucht mit ihr ungeklärte Mordfälle. Im Staffelfinale wird bekannt, dass Bishop NSA-Akten geleakt hat, weswegen sie sich vom Team verabschiedet. Allerdings spricht sie sich noch mit Torres aus, wobei es zu einem Kuss kommt. Danach spricht sie mit der Agentin Odette, welche ihr eine Undercovermission anbietet, jedoch muss laut ihr noch eine Sache getan werden. Unterdessen hat Gibbs sein Boot fertiggestellt und es auf den Namen „Rule 91“ getauft. Als er mit diesem unterwegs ist, explodiert es jedoch urplötzlich. Kurzzeitig treibt er bewusstlos im Fluss, dann wacht er wieder auf und schwimmt davon. Dies bildet den Cliffhanger zur 19. Staffel.